Luật này có hiệu lực từ ngày 01/07/2025. Luật này có sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Hải quan. Theo đó, Doanh nghiệp được công nhận áp dụng chế độ ưu tiên khi đáp ứng đủ các điều kiện sau đây: a) Tuân thủ pháp luật về hải quan, pháp luật về thuế trong 02 năm liên tục; b) Có kim ngạch xuất khẩu, nhập khẩu hằng năm đạt mức quy định; c) Thực hiện thủ tục hải quan điện tử, thủ tục thuế điện tử; có phần mềm hoặc hệ thống công nghệ thông tin quản lý hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu của doanh nghiệp kết nối hoặc chia sẻ với cơ quan hải quan; d) Thực hiện thanh toán qua ngân hàng; đ) Có hệ thống kiểm soát nội bộ; e) Chấp hành tốt quy định của pháp luật về kế toán, kiểm toán. Luật bổ sung quy định liên quan đến hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ đã đăng ký tờ khai nhưng chưa hoàn tất thủ tục hải quan trước thời điểm luật mới có hiệu lực - các trường hợp này được áp dụng theo khoản 3 Điều 3 của Luật số 90/2025/QH15. Bên cạnh đó, Luật sửa đổi mở rộng định nghĩa hàng hóa xuất khẩu và điều chỉnh các quy định về miễn thuế nhập khẩu cho hàng hóa phục vụ phát triển khoa học, công nghệ và công nghiệp công nghệ số.