"Đây l♛à điều vô cùng đáng tiếc", Hayashi nói tại một cuộc họp báo. Ông nói thêm rằng chính phủ Nhật Bản sẽ phản ứng theo cách thống nhất, hợp tác chặt chẽ với các bộ trưởng có liên quan. Hayashi cho biết Nhật Bản đã chính thức yêu cầu chính phủ Hoa Kỳ xem xét lại quyết định này.  Khi được hỏi liệu Nhật Bản có áp dụng các biện pháp đối phó hay không, ông từ chối bình luận về thông tin cụ thể, nói rằng, "Tôi sẽ không tiết lộ chi tiết về các cuộc thảo luận nội bộ của chúng tôi". Hayashi cảnh báo rằng các biện pháp hạn chế thương mại toàn diện của Hoa Kỳ có thể gây ra hậu quả nghiêm trọng đối với mối quan hệ kinh tế Nhật Bản-Hoa Kỳ, nền kinh tế toàn cầu và hệ thống thương mại đa phương.  Ông cho biết chính phủ Nhật Bản sẽ đánh giá tác động đến các ngành công nghiệp trong nước và thực hiện các bước cần thiết để hỗ trợ các ngành bị ảnh hưởng. Ngoài ra, vào thứ năm, Bộ trưởng Kinh tế, Thương mại và Công nghiệp Nhật Bản Yoji Muto đã nêu lên mối lo ngại về việc liệu thuế quan của Hoa Kỳ có tuân thủ các quy tắc của Tổ chức Thương mại Thế giới hay không,  đưa tin. Chính phủ đã thành lập một lực lượng đặc nhiệm để giải quyết những tác động tiềm tàng đối với doanh nghiệp trong nước. Theo Bộ Nông nghiệp, Lâm nghiệp và Thủy sản Nhật Bản, Hoa Kỳ vẫn là điểm đến xuất khẩu lớn nhất của Nhật Bản đối với các sản phẩm nông, lâm nghiệp và thủy sản. Năm 2024, xuất khẩu trong lĩnh vực đó tăng 18% so với cùng kỳ năm trước lên 242,9 tỷ yên (1,62 tỷ USD). Sò điệp đã trở thành mặt hàng xuất khẩu thủy sản hàng đầu của Nhật Bản. Sau lệnh cấm của Trung Quốc đối với thủy sản Nhật Bản vào tháng 8 năm 2023 — được áp dụng sau khi xả nước đã qua xử lý từ nhà máy điện hạt nhân Fukushima Daiichi — Nhật Bản đã tăng đáng kể lượng thủy sản xuất khẩu trực tiếp sang Hoa Kỳ.